More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2521 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  57.83 
 
 
2068 aa  1929    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.27 
 
 
1855 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  46.73 
 
 
1017 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  40.33 
 
 
1328 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.65 
 
 
1176 aa  888    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.55 
 
 
1117 aa  762    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.61 
 
 
1035 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.95 
 
 
891 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 
1975 aa  3918    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  44.88 
 
 
991 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  39.9 
 
 
1329 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  61.78 
 
 
1331 aa  1327    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  64.25 
 
 
1891 aa  2247    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  52.35 
 
 
1942 aa  845    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  47.53 
 
 
1005 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  53.95 
 
 
1025 aa  996    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.75 
 
 
1248 aa  1103    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.06 
 
 
946 aa  824    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  44.37 
 
 
925 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  49.93 
 
 
723 aa  607  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.06 
 
 
1124 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.23 
 
 
2156 aa  586  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  42.03 
 
 
1062 aa  583  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  37.5 
 
 
998 aa  576  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.79 
 
 
1440 aa  570  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.79 
 
 
1440 aa  570  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.47 
 
 
1441 aa  562  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  37.46 
 
 
1472 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  35.78 
 
 
1432 aa  516  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  35.4 
 
 
1450 aa  516  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  40.71 
 
 
717 aa  504  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  46.69 
 
 
609 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 
600 aa  487  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  49.72 
 
 
614 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  33.19 
 
 
1429 aa  459  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  46.05 
 
 
622 aa  445  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  42.83 
 
 
599 aa  427  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  43.01 
 
 
593 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  46.06 
 
 
604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.68 
 
 
1043 aa  281  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.65 
 
 
852 aa  260  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.49 
 
 
850 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.32 
 
 
852 aa  256  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.28 
 
 
848 aa  256  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.15 
 
 
852 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.15 
 
 
852 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  29.56 
 
 
655 aa  253  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.03 
 
 
2638 aa  251  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  27.12 
 
 
640 aa  250  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.95 
 
 
655 aa  250  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.44 
 
 
647 aa  240  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  29.7 
 
 
852 aa  240  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  29.7 
 
 
848 aa  240  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  28.74 
 
 
874 aa  239  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  29.6 
 
 
856 aa  238  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  30.28 
 
 
1136 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  29.53 
 
 
852 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  28.5 
 
 
1064 aa  235  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  28.5 
 
 
1064 aa  234  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.48 
 
 
620 aa  233  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  27.03 
 
 
825 aa  229  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.5 
 
 
1888 aa  226  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.69 
 
 
928 aa  219  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  26.3 
 
 
843 aa  214  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  31.48 
 
 
718 aa  213  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.06 
 
 
899 aa  211  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  25.97 
 
 
843 aa  206  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 
510 aa  206  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 
838 aa  201  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.92 
 
 
841 aa  201  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  27.68 
 
 
669 aa  200  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  28.25 
 
 
601 aa  199  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  26.18 
 
 
842 aa  199  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  29.69 
 
 
885 aa  196  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  26.19 
 
 
766 aa  194  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  25.37 
 
 
713 aa  192  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  24.67 
 
 
713 aa  191  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  24.96 
 
 
713 aa  191  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  24.96 
 
 
713 aa  191  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.47 
 
 
713 aa  190  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 
511 aa  188  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  24.52 
 
 
713 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  24.34 
 
 
713 aa  188  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.47 
 
 
713 aa  188  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  49.5 
 
 
1401 aa  188  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  24.52 
 
 
713 aa  187  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  23.82 
 
 
713 aa  186  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.26 
 
 
564 aa  184  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.53 
 
 
640 aa  180  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  29.36 
 
 
571 aa  178  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  24.34 
 
 
776 aa  178  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  45.99 
 
 
1401 aa  174  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 
524 aa  173  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  24.56 
 
 
712 aa  173  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 
836 aa  171  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  25.52 
 
 
1252 aa  171  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.24 
 
 
814 aa  169  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 
528 aa  169  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.67 
 
 
528 aa  168  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  30.04 
 
 
642 aa  168  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>