More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2460 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 330 aa  625  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  41.4 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  38.99 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.96 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  39.11 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  36.4 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.72 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  33.46 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.44 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  35 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  34.83 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.34 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.55 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  33.8 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  34.84 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  33.7 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.93 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  31.23 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.22 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  31.69 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.71 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  35.44 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.88 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.98 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  35.21 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  35.21 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  35.81 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  36.16 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  34.59 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  37.27 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  32.12 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  31.21 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  35.13 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35.1 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.9 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  33.69 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  34.91 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.51 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.72 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.72 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.69 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  30.4 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  32.08 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  36.57 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.54 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  32.4 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.3 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.42 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  34.34 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  34.35 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  35.88 
 
 		 308 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  35.51 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  34.35 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  25.16 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  34.29 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25.49 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.17 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.19 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.9 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.84 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  32.23 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.84 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.61 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  33.76 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  28.84 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  33.76 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  31.87 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25.49 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25.49 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  32.79 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.99 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  31.75 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  34.31 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>