47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2380 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  100 
 
 		 867 aa  1735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  41.36 
 
 		 967 aa  512  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  48.19 
 
 		 879 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  35.56 
 
 		 928 aa  228  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  35.51 
 
 		 695 aa  219  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  46.32 
 
 		 986 aa  217  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  30.47 
 
 		 1040 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0161  hypothetical protein  48.91 
 
 		 323 aa  200  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.124913  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  29.89 
 
 		 780 aa  200  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0579  hypothetical protein  44.54 
 
 		 308 aa  197  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.404895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  37.02 
 
 		 475 aa  130  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  30.27 
 
 		 654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  38.21 
 
 		 306 aa  118  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  36.33 
 
 		 664 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  35.32 
 
 		 351 aa  112  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.03 
 
 		 846 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  34.83 
 
 		 595 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  34.11 
 
 		 407 aa  98.2  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  35.23 
 
 		 617 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  27.91 
 
 		 396 aa  94  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  31.3 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  35.8 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  28.99 
 
 		 708 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  25.52 
 
 		 754 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  26.91 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  25.26 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  25.26 
 
 		 706 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 		 892 aa  81.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  35.59 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  34.87 
 
 		 496 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  31.21 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  36.57 
 
 		 537 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  31.17 
 
 		 205 aa  67  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  36.57 
 
 		 537 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  36.57 
 
 		 537 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  37.3 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  25.36 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  38.68 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  39.45 
 
 		 370 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  36 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  38.46 
 
 		 541 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  37.14 
 
 		 539 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  30.64 
 
 		 300 aa  56.2  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  35.35 
 
 		 186 aa  53.5  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1848  CHAP domain containing protein  39.68 
 
 		 428 aa  48.5  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416568  normal  0.0942839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1849  CHAP domain containing protein  40 
 
 		 426 aa  46.6  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.756572  normal  0.0939049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2546  hypothetical protein  33.61 
 
 		 270 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>