More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2293 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  71.75 
 
 		 234 aa  307  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  66.67 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  72.09 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  74.21 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  60.96 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  64.79 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  59.55 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  56.52 
 
 		 246 aa  248  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  59.56 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  60.43 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  60.09 
 
 		 276 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  58.93 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  58.74 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  60.37 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  60.89 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  60.77 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  62.04 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  60.37 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  63.21 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  64.29 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  57.47 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  63.08 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  57.87 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  58.99 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  56.19 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  58.37 
 
 		 267 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  61.54 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  56.46 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  56.46 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  56.46 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  63.02 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  60.18 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  53.52 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  62.22 
 
 		 270 aa  207  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  50.88 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  48.47 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  50.87 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  45.7 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  49.3 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  48.66 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  45.07 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.4 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.82 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  44.05 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  47.47 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.93 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.26 
 
 		 241 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.81 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.51 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.36 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.92 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.27 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  48.04 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.06 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  45.15 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  46.77 
 
 		 385 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  45.75 
 
 		 383 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  45.75 
 
 		 383 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.33 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.38 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.26 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  45.69 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.38 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  47.09 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.38 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  46.95 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.63 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.38 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.27 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.26 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  42.61 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  44.3 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  40.76 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.23 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.4 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  42.56 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.42 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  45.45 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.67 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.76 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.92 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.07 
 
 		 228 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  41.23 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.76 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.47 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.86 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.89 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  40.48 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.63 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>