More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2289 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 590 aa  1158    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  60.56 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  63.05 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 		 571 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  37.19 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  35.55 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.08 
 
 		 566 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  38.55 
 
 		 573 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 573 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 595 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  36.85 
 
 		 577 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  36.13 
 
 		 536 aa  238  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 565 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  35.49 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 566 aa  230  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 579 aa  224  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 568 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 568 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 631 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 568 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 568 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 566 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 566 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 566 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  34.95 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  33.74 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  30.73 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  37.75 
 
 		 401 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  37.43 
 
 		 382 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  32.22 
 
 		 635 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  33.33 
 
 		 385 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 		 392 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  39.22 
 
 		 373 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  32.06 
 
 		 673 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 421 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  29.13 
 
 		 851 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 386 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 393 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  32 
 
 		 484 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 665 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.23 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 		 795 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 709 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30.22 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  28.44 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 960 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 345 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  29.84 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  27.85 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  30.99 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 795 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 606 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 780 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  25.54 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  31.7 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.43 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.34 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 605 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 780 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.43 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0444  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.62 
 
 		 603 aa  67  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>