More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2258 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
680 aa  1321    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  56.81 
 
 
698 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  56.39 
 
 
682 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  54.19 
 
 
689 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  52.77 
 
 
671 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  48.36 
 
 
788 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  49.78 
 
 
687 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.92 
 
 
787 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  39.09 
 
 
743 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  30.88 
 
 
744 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  42.93 
 
 
646 aa  320  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.57 
 
 
656 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  36.55 
 
 
653 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  48.25 
 
 
639 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  36.35 
 
 
657 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 
725 aa  283  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  30.74 
 
 
697 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
656 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  46.29 
 
 
634 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  54.41 
 
 
619 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  49.82 
 
 
652 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  47.74 
 
 
665 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  43.12 
 
 
432 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  42.98 
 
 
662 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  31.71 
 
 
1085 aa  231  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  35.79 
 
 
749 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  42.53 
 
 
697 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  40.7 
 
 
450 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  48.83 
 
 
444 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
450 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 
450 aa  214  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  44.19 
 
 
450 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  50.78 
 
 
445 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  38.76 
 
 
434 aa  207  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  45.17 
 
 
478 aa  207  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  44.06 
 
 
448 aa  206  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 
466 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  37.46 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  45.54 
 
 
478 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  43.12 
 
 
448 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.82 
 
 
622 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  35.99 
 
 
1193 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  42.31 
 
 
441 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  38.38 
 
 
459 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
299 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
134 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.1 
 
 
352 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.03 
 
 
228 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  34.55 
 
 
305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  25.88 
 
 
570 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  25.88 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  27.84 
 
 
570 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  25.88 
 
 
570 aa  114  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  28.52 
 
 
578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  34.25 
 
 
387 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.04 
 
 
580 aa  112  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  28.68 
 
 
569 aa  110  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.86 
 
 
617 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  34.71 
 
 
328 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
577 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.97 
 
 
326 aa  99  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  29.15 
 
 
443 aa  97.4  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.7 
 
 
795 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  34.76 
 
 
308 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  31.72 
 
 
348 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  40.56 
 
 
772 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  37.01 
 
 
336 aa  90.1  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 
775 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  37.93 
 
 
771 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  36.81 
 
 
789 aa  87.4  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 
332 aa  87  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  36.11 
 
 
789 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.88 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.09 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 
698 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  26.89 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  28.66 
 
 
771 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  29.6 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.92 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.26 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  30.58 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  38.52 
 
 
766 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.23 
 
 
477 aa  84  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  36.77 
 
 
336 aa  84  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  31.4 
 
 
336 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.43 
 
 
321 aa  84  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  37.41 
 
 
322 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  27.45 
 
 
329 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 
328 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  28.26 
 
 
773 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  27.45 
 
 
329 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  28.71 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 
773 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.57 
 
 
360 aa  83.2  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31.4 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  30.85 
 
 
328 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  24.49 
 
 
393 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.16 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>