More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2227 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  41.84 
 
 		 242 aa  127  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  31.94 
 
 		 402 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  38.1 
 
 		 428 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  40.98 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  34.52 
 
 		 404 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  40 
 
 		 403 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  35.92 
 
 		 416 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  38.89 
 
 		 445 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  38.94 
 
 		 447 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  36.55 
 
 		 431 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  37.82 
 
 		 448 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  33.98 
 
 		 403 aa  91.7  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 408 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  37.91 
 
 		 402 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  32.83 
 
 		 423 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  32.65 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.9 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 423 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  29.23 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  33.97 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  30.15 
 
 		 412 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  29.74 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  29.9 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  24.26 
 
 		 397 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 424 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.35 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  25.74 
 
 		 410 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.15 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  25.89 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  29.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  25.85 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  27.14 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  28.5 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  27.5 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  25.12 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  25.64 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  26 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  28.79 
 
 		 407 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  23.74 
 
 		 405 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  30.3 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  22.5 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  26.15 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  25.77 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 412 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 400 aa  64.7  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  28.92 
 
 		 411 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  29.38 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.33 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  29.47 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  32.82 
 
 		 450 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  28.28 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  32.51 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  29.56 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  29.56 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  23.32 
 
 		 411 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2651  inner membrane protein YfgF  30.84 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2763  hypothetical protein  30.84 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2699  inner membrane protein YfgF  30.84 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.995527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  25.65 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2872  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.84 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2741  inner membrane protein YfgF  30.19 
 
 		 737 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.306785 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3101  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.18 
 
 		 772 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  32.28 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.18 
 
 		 772 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.660713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 458 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  25.77 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2786  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.43 
 
 		 747 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.491655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3726  putative cytochrome C-type biogenesis protein  34.43 
 
 		 747 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.467622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3732  diguanylate phosphodiesterase  33.77 
 
 		 271 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.731065  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3196  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.52 
 
 		 497 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  31.19 
 
 		 485 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2349  diguanylate phosphodiesterase  23.26 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.61 
 
 		 747 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0079949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2651  putative cytochrome C-type biogenesis protein  33.61 
 
 		 747 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2326  diguanylate phosphodiesterase  33.59 
 
 		 760 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.868867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  30.51 
 
 		 689 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  36.89 
 
 		 340 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 		 416 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2712  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 793 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  29.61 
 
 		 426 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3252  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.6 
 
 		 620 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2928  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.66 
 
 		 731 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0860795  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  30.52 
 
 		 426 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 448 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>