33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2217 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 
252 aa  487  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  45.53 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  37.66 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  37.83 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  36.84 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  33.76 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  30.93 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  31.02 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  35.32 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  34.25 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  35.27 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  30.97 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  31.96 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  33.79 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  31.34 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  33.54 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  33.54 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  29.69 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  33.54 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  29.7 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  29.79 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  33.5 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  28.27 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  29.86 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  28.05 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  29.91 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  26.64 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  30.57 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  29.28 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  28.45 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  27.7 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  34 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>