54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2159 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 72 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  68.12 
 
 		 71 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0294  DNA binding domain protein, excisionase family  76.79 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3348  excisionase family DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.401166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8997  hypothetical protein  76.36 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2068  DNA binding domain-containing protein  72.88 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  76.27 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  76.27 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2751  excisionase/Xis, DNA-binding  73.21 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0704152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  73.68 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4391  DNA binding domain protein, excisionase family  74.55 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0099  excisionase/Xis, DNA-binding  77.36 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7205  DNA binding domain-containing protein  77.36 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0300475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  76.47 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  70.97 
 
 		 69 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  81.25 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  72.22 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  78.43 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2349  DNA binding domain protein, excisionase family  72.55 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  75 
 
 		 69 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  76 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  76 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  76 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  76 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  72.22 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  70.37 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  69.09 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  76 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  72.92 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 72 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  72.92 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  62.5 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  60.42 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1644  regulatory protein MerR  70 
 
 		 41 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  49.25 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9401  hypothetical protein  54.55 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  52.83 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  42.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  44.44 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  47.27 
 
 		 219 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  46.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 216 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  42.86 
 
 		 243 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>