134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2125 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  100 
 
 
365 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  67.9 
 
 
358 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  60 
 
 
321 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  53.45 
 
 
366 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  53.82 
 
 
362 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  52.21 
 
 
364 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  53.15 
 
 
362 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  50 
 
 
366 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  50.14 
 
 
357 aa  338  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  48.04 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  48.02 
 
 
360 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  45.98 
 
 
357 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  48.97 
 
 
370 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  43.81 
 
 
346 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  43.77 
 
 
347 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  45.53 
 
 
375 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  44.98 
 
 
347 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  38.65 
 
 
346 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  38.14 
 
 
341 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  33.23 
 
 
342 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  29.89 
 
 
477 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  27.88 
 
 
366 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04592  fatty acid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02130)  24.1 
 
 
545 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83317  predicted protein  25.28 
 
 
573 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000217619  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03590  delta 8-sphingolipid desaturase, putative  26.34 
 
 
535 aa  92.8  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.194503  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  23.97 
 
 
498 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  29.64 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  27.08 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  26.45 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94891  predicted protein  25.31 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.700078 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31472  predicted protein  24.29 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  23.45 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  28.03 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  29.79 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  29.79 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50443  predicted protein  26.69 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00232774  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  26.32 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  31.93 
 
 
760 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  25.81 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  29.04 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  26.38 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  28.47 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  26.3 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  27.07 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  26.91 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  23.79 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  40 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  26.25 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  28.16 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  26.85 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  27.64 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  27.42 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  27.64 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  27.64 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  37.23 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  26.82 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  32.63 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  32.63 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  32.63 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  25.95 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  35.96 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  29.22 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.49 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.87 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.38 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  26.34 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  24.79 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  26.44 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  32.58 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  36.46 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  29.2 
 
 
448 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.1 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.74 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  35.42 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.74 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  20.53 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  37.21 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  38.57 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  25.51 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.74 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  32.22 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  37.68 
 
 
418 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  23.55 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  22.69 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  25 
 
 
464 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  25 
 
 
464 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  25 
 
 
464 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  25.58 
 
 
455 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>