68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2108 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  100 
 
 		 167 aa  326  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  47.24 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  43.9 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  45 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  43.75 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  35.88 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  26.83 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  40.83 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  37.8 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  35.71 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  32.95 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  31.33 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  33.74 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  31.33 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  32.6 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  33.12 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  25.88 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  35.77 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  29.94 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  28.66 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  27.49 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.12 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.78 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.89 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  27.88 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  22.91 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  22.79 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  22.06 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  30.77 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  22.06 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  23.67 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  27.43 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  23.26 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  20 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  22.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  24.39 
 
 		 178 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.05 
 
 		 156 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  22.36 
 
 		 335 aa  41.6  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  20.93 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0038  protoporphyrinogen oxidase  20.93 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.43 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  23.81 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>