More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2024 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  80.18 
 
 		 820 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 756 aa  1548    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  68.02 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  62.17 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  61.57 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  63.1 
 
 		 829 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  60 
 
 		 451 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  61.75 
 
 		 1001 aa  469  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  60.7 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  71.47 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  57.72 
 
 		 815 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  70.07 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  49.19 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  61.06 
 
 		 370 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.95 
 
 		 474 aa  326  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  41.88 
 
 		 503 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20370  hypothetical protein  57.96 
 
 		 284 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0877904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.51 
 
 		 488 aa  301  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2984  hypothetical protein  56.08 
 
 		 285 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  39.74 
 
 		 491 aa  277  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  39.91 
 
 		 451 aa  274  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  39.56 
 
 		 477 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  36.53 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2700  hypothetical protein  51.23 
 
 		 281 aa  270  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.354458  normal  0.669762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.62 
 
 		 778 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  45.81 
 
 		 423 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  47.94 
 
 		 543 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.07 
 
 		 490 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.48 
 
 		 678 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 		 837 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  43.99 
 
 		 309 aa  230  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 		 628 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  36.42 
 
 		 347 aa  221  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.32 
 
 		 333 aa  220  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  36 
 
 		 347 aa  218  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  36.76 
 
 		 371 aa  210  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  36.57 
 
 		 389 aa  204  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2249  hypothetical protein  40.48 
 
 		 295 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  36.23 
 
 		 366 aa  197  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  34.65 
 
 		 373 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02789  conserved hypothetical protein  43.4 
 
 		 328 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  34.85 
 
 		 323 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.77 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  35.18 
 
 		 383 aa  188  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 		 1037 aa  187  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  33.33 
 
 		 399 aa  187  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.5 
 
 		 328 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.14 
 
 		 697 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.55 
 
 		 689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.29 
 
 		 1478 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.2 
 
 		 324 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  31.59 
 
 		 1041 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  37.32 
 
 		 317 aa  177  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  32.79 
 
 		 394 aa  177  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.18 
 
 		 619 aa  175  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34.55 
 
 		 376 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.12 
 
 		 321 aa  172  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  32.69 
 
 		 398 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.69 
 
 		 1059 aa  171  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.69 
 
 		 1059 aa  171  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 359 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.54 
 
 		 338 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.98 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 337 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  33.65 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  34.44 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  37.45 
 
 		 321 aa  164  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.96 
 
 		 1050 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.89 
 
 		 1495 aa  163  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 		 374 aa  163  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  30.91 
 
 		 369 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  33.22 
 
 		 331 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 370 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  27.74 
 
 		 373 aa  161  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.29 
 
 		 1019 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 		 364 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  28.16 
 
 		 486 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  34.47 
 
 		 1020 aa  154  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.14 
 
 		 770 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 		 370 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  29.55 
 
 		 407 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  34.85 
 
 		 2457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.83 
 
 		 357 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.04 
 
 		 806 aa  144  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 		 1077 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.31 
 
 		 392 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  31.31 
 
 		 388 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.75 
 
 		 355 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.95 
 
 		 756 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  29.81 
 
 		 1018 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.7 
 
 		 382 aa  136  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.63 
 
 		 357 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  30.99 
 
 		 566 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 		 619 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  29.33 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.14 
 
 		 357 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 368 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.32 
 
 		 561 aa  128  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>