More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2018 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
171 aa  332  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 
171 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  54.86 
 
 
157 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 
180 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 
180 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
180 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.03 
 
 
169 aa  150  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  58.16 
 
 
157 aa  150  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  52.11 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 
169 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.03 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  51.75 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
157 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
153 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
154 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
152 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 
165 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
158 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  43.29 
 
 
167 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
167 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
165 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
166 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
157 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
154 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
166 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  39.13 
 
 
169 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
158 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  38.13 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  38.13 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  39.57 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
153 aa  98.2  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
151 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  41.54 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  35.21 
 
 
155 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  38.89 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
156 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  41.6 
 
 
134 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
155 aa  94.4  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
158 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
150 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
157 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
175 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
153 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
156 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
153 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
154 aa  91.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
154 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
150 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
154 aa  90.9  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
176 aa  90.5  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
150 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>