87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2009 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  77.54 
 
 
283 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  70.59 
 
 
306 aa  400  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  69.4 
 
 
283 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  65.66 
 
 
294 aa  347  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  59.34 
 
 
282 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  59.85 
 
 
284 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  58.67 
 
 
284 aa  322  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  57.51 
 
 
283 aa  322  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  58.96 
 
 
301 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  57.41 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  58.67 
 
 
281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  58.58 
 
 
279 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  55.56 
 
 
296 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  59.34 
 
 
286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  55.68 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  52.86 
 
 
292 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  53.17 
 
 
296 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  52.13 
 
 
296 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  52.13 
 
 
296 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  54.98 
 
 
298 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  53.96 
 
 
286 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  51.77 
 
 
296 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  54.04 
 
 
290 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  52.19 
 
 
289 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  51.23 
 
 
288 aa  285  8e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  51.27 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  53.73 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  54.98 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  52.19 
 
 
289 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  52.31 
 
 
302 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  50.9 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  47.55 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  51.08 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  51.64 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  45.05 
 
 
282 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.59 
 
 
297 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  42.45 
 
 
299 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.94 
 
 
311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  31.37 
 
 
277 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.33 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.03 
 
 
329 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  29.09 
 
 
311 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  30.74 
 
 
315 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  28.33 
 
 
330 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  28.27 
 
 
311 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  27.52 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  27.52 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  28.78 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.93 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  27.52 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.08 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  27.9 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  31.15 
 
 
312 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  29.47 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  26.42 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  28.32 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  24.91 
 
 
307 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.15 
 
 
304 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  26.73 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  24.74 
 
 
301 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  27.59 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.79 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.08 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  25.54 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  29.96 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  26.73 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  26.13 
 
 
302 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  30.35 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  25.9 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  27.68 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  23.77 
 
 
312 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  25.62 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  24.9 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  23.81 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  25.1 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  25.71 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  24.32 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  23.17 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  23.58 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  23.31 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  26.61 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  28.07 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  23.9 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.41 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  23.45 
 
 
250 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>