More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1903 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  100 
 
 		 311 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  48.21 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  50.97 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  51.95 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  45.19 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  42.99 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  40.74 
 
 		 763 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  40.58 
 
 		 759 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  42.71 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  38.67 
 
 		 831 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  41.19 
 
 		 852 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  40.68 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 758 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 758 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  40.32 
 
 		 758 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  38.98 
 
 		 766 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  39.35 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  40.97 
 
 		 815 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  38.78 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  40.51 
 
 		 847 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  41.08 
 
 		 845 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  36.99 
 
 		 847 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  37.54 
 
 		 863 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  39.02 
 
 		 358 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  34.38 
 
 		 608 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  41.05 
 
 		 816 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  33.67 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  36.99 
 
 		 867 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  38.8 
 
 		 778 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  31.25 
 
 		 861 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  32.57 
 
 		 896 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  36.95 
 
 		 882 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  39.17 
 
 		 828 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  39.43 
 
 		 846 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  35.64 
 
 		 822 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  31.19 
 
 		 902 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  28.43 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.12 
 
 		 646 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.14 
 
 		 797 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  35.13 
 
 		 847 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  36.36 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  31.72 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  36.36 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  35.71 
 
 		 656 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  38.36 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  33.97 
 
 		 851 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  36.54 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  35.13 
 
 		 825 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  31.17 
 
 		 877 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  36.62 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.61 
 
 		 858 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 351 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  37.25 
 
 		 684 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  34.09 
 
 		 871 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  28.84 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  41.08 
 
 		 896 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  33.54 
 
 		 845 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  37.21 
 
 		 658 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  35.33 
 
 		 840 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  31.83 
 
 		 657 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  32.58 
 
 		 534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  35.48 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  36.25 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  33.85 
 
 		 864 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  32.6 
 
 		 954 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.82 
 
 		 354 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  34.91 
 
 		 847 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  33.02 
 
 		 866 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  32.61 
 
 		 834 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  34.82 
 
 		 872 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  33.75 
 
 		 940 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 833 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  35.31 
 
 		 683 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.65 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  35.05 
 
 		 837 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.62 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0365  ATP dependent DNA ligase  28.85 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.02 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  31.82 
 
 		 603 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  36.86 
 
 		 936 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  36.86 
 
 		 936 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  32.8 
 
 		 833 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  28.08 
 
 		 855 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  32.78 
 
 		 853 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 871 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  32.67 
 
 		 883 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 901 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  34.11 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  28.52 
 
 		 813 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  35.03 
 
 		 856 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  32.7 
 
 		 825 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  32.28 
 
 		 848 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  33.12 
 
 		 832 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  29.22 
 
 		 818 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  31.67 
 
 		 881 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  27.9 
 
 		 815 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  27.18 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  30.23 
 
 		 865 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  33.23 
 
 		 651 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>