More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1853 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
399 aa  799    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  82.44 
 
 
397 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  80.99 
 
 
400 aa  632  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  73.28 
 
 
398 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  75.63 
 
 
399 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  73.57 
 
 
407 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  73.54 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  72.5 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  72.08 
 
 
397 aa  568  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  73.35 
 
 
417 aa  568  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  72.26 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  72.84 
 
 
395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  71.83 
 
 
397 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  71.25 
 
 
411 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  72.84 
 
 
398 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  72.34 
 
 
395 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  72.26 
 
 
398 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  70.56 
 
 
397 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  73.35 
 
 
397 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  70.2 
 
 
399 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  71.61 
 
 
401 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  69.95 
 
 
399 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  71.25 
 
 
398 aa  546  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  69.98 
 
 
403 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  72.38 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  68.26 
 
 
420 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  69.5 
 
 
400 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  71.02 
 
 
396 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  67.74 
 
 
402 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  69.61 
 
 
399 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 
401 aa  527  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  69.27 
 
 
407 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 
402 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 
402 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 
402 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  68.17 
 
 
402 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  67.92 
 
 
402 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 
396 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  68.92 
 
 
405 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  64.18 
 
 
397 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 
395 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  67.42 
 
 
403 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  62.21 
 
 
396 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 
395 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  63.75 
 
 
403 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  63.61 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 
396 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
396 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  63.36 
 
 
399 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.62 
 
 
395 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  63.36 
 
 
399 aa  494  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  63.36 
 
 
399 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
395 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  63.36 
 
 
399 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  64.69 
 
 
393 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
395 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  63.94 
 
 
397 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  64.36 
 
 
397 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  60.81 
 
 
396 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  63.09 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 
388 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  61.27 
 
 
403 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 
396 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  60.31 
 
 
396 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
382 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 
395 aa  485  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  61.83 
 
 
395 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  61.8 
 
 
421 aa  481  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 
396 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  61.44 
 
 
402 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
398 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
403 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
398 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
384 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  61.83 
 
 
384 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 
402 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4271  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
406 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268739  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
384 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  61.83 
 
 
384 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  62.13 
 
 
396 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  60.97 
 
 
385 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  61.83 
 
 
390 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
383 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.24 
 
 
408 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  63.31 
 
 
388 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>