More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1818 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
893 aa  979    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
897 aa  1783    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 
892 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
889 aa  851    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
885 aa  844    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
897 aa  871    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
890 aa  776    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
889 aa  870    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 
895 aa  1162    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  73.8 
 
 
895 aa  1281    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
888 aa  858    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
900 aa  758    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  54.01 
 
 
890 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  70.54 
 
 
896 aa  1106    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 
895 aa  1093    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
903 aa  897    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
892 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
881 aa  782    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
892 aa  881    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
891 aa  799    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
898 aa  913    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
890 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
889 aa  833    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 
902 aa  1145    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
897 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
897 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
893 aa  873    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  56.16 
 
 
894 aa  933    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
888 aa  877    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
876 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
898 aa  753    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
904 aa  737    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
892 aa  916    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 
886 aa  873    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
896 aa  896    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 
889 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
897 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
898 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
893 aa  955    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
880 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
886 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
886 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
879 aa  622  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
878 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
874 aa  614  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
889 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
886 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
859 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
878 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
879 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
876 aa  611  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
865 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 
876 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
882 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
878 aa  606  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
878 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
892 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
875 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
876 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
889 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
881 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
883 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
882 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
874 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
881 aa  596  1e-169  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
878 aa  595  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
874 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
877 aa  594  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
874 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
887 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
874 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
897 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
867 aa  592  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
905 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
863 aa  589  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
897 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
879 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
897 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
874 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
876 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
877 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
878 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
879 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
880 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
874 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
880 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
880 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
874 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
880 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
880 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
860 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
880 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
931 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
877 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
874 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
885 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>