More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1675 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
449 aa  885    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  82.05 
 
 
435 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  74.59 
 
 
432 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  74.24 
 
 
435 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  75.28 
 
 
446 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.15 
 
 
433 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.12 
 
 
435 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.69 
 
 
425 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.44 
 
 
421 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.94 
 
 
419 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.74 
 
 
421 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  61.72 
 
 
429 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  61.14 
 
 
417 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.34 
 
 
415 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  61.24 
 
 
424 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.86 
 
 
441 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.21 
 
 
443 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.37 
 
 
443 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.23 
 
 
417 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61 
 
 
426 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.23 
 
 
417 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.23 
 
 
417 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.05 
 
 
441 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.81 
 
 
442 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  60.79 
 
 
441 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.05 
 
 
442 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0603  selenocysteine lyase  56.84 
 
 
424 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.09 
 
 
411 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  54.65 
 
 
452 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.55 
 
 
434 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.15 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  56.43 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.18 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.4 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.98 
 
 
428 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.14 
 
 
419 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.06 
 
 
414 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.95 
 
 
412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.07 
 
 
435 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.26 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.69 
 
 
412 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.41 
 
 
414 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.83 
 
 
414 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.56 
 
 
420 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  46.01 
 
 
428 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.79 
 
 
451 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  46.19 
 
 
434 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.8 
 
 
408 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.91 
 
 
414 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  47.34 
 
 
426 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  46 
 
 
417 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.61 
 
 
425 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.41 
 
 
657 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  44.06 
 
 
420 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.09 
 
 
414 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.96 
 
 
419 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.26 
 
 
662 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.35 
 
 
420 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  42.11 
 
 
420 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.28 
 
 
429 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.89 
 
 
416 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  37.65 
 
 
417 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.69 
 
 
429 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.72 
 
 
419 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.48 
 
 
414 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  44.29 
 
 
423 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.8 
 
 
414 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.29 
 
 
418 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 
406 aa  368  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.69 
 
 
429 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  47.49 
 
 
496 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.21 
 
 
429 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.91 
 
 
415 aa  368  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.22 
 
 
427 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.44 
 
 
406 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  49.16 
 
 
408 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.53 
 
 
408 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.56 
 
 
417 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.14 
 
 
409 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  44.63 
 
 
414 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.63 
 
 
408 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  44.63 
 
 
414 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.76 
 
 
413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.56 
 
 
425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.6 
 
 
406 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.5 
 
 
420 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.5 
 
 
417 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  44.58 
 
 
682 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.95 
 
 
605 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  36.93 
 
 
417 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.81 
 
 
420 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  38.65 
 
 
416 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.35 
 
 
414 aa  361  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.89 
 
 
416 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  43.54 
 
 
419 aa  360  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  44.09 
 
 
688 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.83 
 
 
412 aa  359  5e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.98 
 
 
774 aa  359  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.98 
 
 
404 aa  358  8e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>