221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1572 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  100 
 
 		 702 aa  1400    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  54.63 
 
 		 673 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  47.69 
 
 		 621 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  31.74 
 
 		 545 aa  253  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  30.53 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  28.44 
 
 		 477 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  53.47 
 
 		 422 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  57.29 
 
 		 453 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  52.58 
 
 		 449 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.97 
 
 		 474 aa  99  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  55.1 
 
 		 478 aa  97.8  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 846 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  56.63 
 
 		 593 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  52.08 
 
 		 349 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  38.82 
 
 		 792 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  50 
 
 		 456 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.45 
 
 		 477 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  56.1 
 
 		 451 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  41.89 
 
 		 460 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  49.48 
 
 		 313 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  48.98 
 
 		 372 aa  87.8  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.67 
 
 		 437 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  51.22 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  45.33 
 
 		 756 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  52.58 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.52 
 
 		 847 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  51.02 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  58.24 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  58.62 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  45.26 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  50.51 
 
 		 820 aa  81.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  49.43 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  48.45 
 
 		 441 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  52.04 
 
 		 362 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  40.62 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  47.54 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  48.19 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  45.13 
 
 		 471 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.79 
 
 		 609 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  56.34 
 
 		 359 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.53 
 
 		 925 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  24.21 
 
 		 1805 aa  75.1  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  41.94 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  48.94 
 
 		 900 aa  74.7  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.58 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  39.53 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  48.42 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  51.16 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  44.66 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.41 
 
 		 694 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  49.47 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  42.24 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 1209 aa  70.1  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  42.68 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  44.19 
 
 		 597 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  51.9 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  44.32 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  53.95 
 
 		 89 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  44.19 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.32 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  38.82 
 
 		 942 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.27 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.53 
 
 		 913 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  39.08 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.66 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.22 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  39.8 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  42.53 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  41.49 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  37.76 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  45.26 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  43.02 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  42.86 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  38.37 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.8 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40 
 
 		 744 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.53 
 
 		 774 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  41.86 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  33.12 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.16 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.53 
 
 		 979 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.5 
 
 		 767 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.38 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  47.57 
 
 		 978 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  43.04 
 
 		 436 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 854 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  35.2 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  43.48 
 
 		 829 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  37.93 
 
 		 485 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  42.68 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  40.91 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.64 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  55.95 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>