More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1439 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.659943  normal  0.282121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.31 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.33 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.83336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23940  short-chain alcohol dehydrogenase  65.74 
 
 
280 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393654  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  61.89 
 
 
266 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.96 
 
 
262 aa  269  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  57.09 
 
 
261 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 
250 aa  254  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
248 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
250 aa  251  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
254 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  55.92 
 
 
245 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.47 
 
 
248 aa  244  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
255 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  57.74 
 
 
251 aa  240  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 
261 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
253 aa  238  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 
253 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
259 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
252 aa  224  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
243 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
243 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
251 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
251 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
227 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0791624  normal  0.128025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  46.69 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.34 
 
 
248 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
254 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  39.67 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.6 
 
 
250 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.07 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
248 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  42.44 
 
 
255 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
250 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
250 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
250 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
253 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
256 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
251 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
261 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
250 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  43.39 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  40.59 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  40.17 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  40.66 
 
 
282 aa  160  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
254 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
267 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
257 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
251 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
252 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.25 
 
 
254 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1418  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.57 
 
 
248 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000653973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
256 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.08 
 
 
253 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.76 
 
 
253 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
252 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.71 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
254 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
253 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  37.7 
 
 
269 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
254 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.71 
 
 
248 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.71 
 
 
248 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.71 
 
 
248 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.14 
 
 
248 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.71 
 
 
248 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
258 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  35.34 
 
 
257 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
248 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
250 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.14 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  35.34 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>