158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1359 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1359  globin  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  80.65 
 
 		 133 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  80.16 
 
 		 127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  76.42 
 
 		 149 aa  199  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  74.4 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  69.6 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  69.67 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  71.77 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  72.36 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  72.95 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  72.5 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  70.4 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  70.4 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  65.85 
 
 		 357 aa  172  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  65.85 
 
 		 173 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  60.98 
 
 		 124 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  64.23 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  65.83 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  66.95 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  61.48 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  63.87 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  61.67 
 
 		 132 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  59.35 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  63.03 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  59.52 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  57.26 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  60 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  60.16 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  57.94 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  59.52 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  56.91 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  56.91 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  56.91 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  53.17 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  54.84 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  46.34 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  46.67 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  45.9 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  42.15 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  40.5 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  38.71 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  38.14 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  37.29 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  37.29 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  37.29 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  37.29 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  37.29 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  37.29 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  36.44 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  38.66 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  35.48 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  38.66 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  38.21 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  40.52 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  39.83 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  37.4 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  40.86 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  35.43 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  34.17 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  29.41 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  30.97 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  29.41 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  35.2 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  29.41 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  31.3 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  31.3 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  35.83 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  38.38 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  35.71 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  28.57 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  32.56 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  34.71 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  33.61 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  34.71 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  28.57 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  26.67 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  36.46 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  32.54 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  35 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  27.42 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  34.19 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  31.71 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  28.57 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  37.23 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  33.33 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  33.66 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  33.33 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  32 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  31.4 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  27.34 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  27.73 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  27.73 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  26.89 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  27.73 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>