51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1329 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  47.28 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  42.13 
 
 
221 aa  121  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  43.06 
 
 
225 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  34.88 
 
 
243 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  40.24 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  39.61 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  31.1 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  34.68 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  30.06 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  31.82 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  29.45 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  30.52 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  30.95 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  34.06 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  34.9 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  33.81 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  28.29 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  34.53 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  30.59 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  31.65 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  31.85 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  27.62 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  32 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  29.22 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  29.28 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  30.89 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  28.29 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  31.47 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  36.99 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  30.18 
 
 
207 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  26.74 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  29.29 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  30.18 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  27.55 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  24.65 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  27.04 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  28.11 
 
 
214 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0743  hypothetical protein  18.22 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.247142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  28.3 
 
 
212 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>