73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1304 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1304  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  100 
 
 		 311 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.730307  decreased coverage  0.000389151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4692  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  49.64 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4079  putative ADA-like transcriptional regulator-AraC family  50.18 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1375  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  47.86 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4314  putative DNA repair protein  47.57 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10143  hypothetical protein  46.04 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0745  putative regulatory protein Ada  46.33 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0084  hypothetical protein  49.31 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5452  hypothetical protein  46.04 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1548  hypothetical protein  47.02 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5161  hypothetical protein  45.68 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205602  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5073  hypothetical protein  45.68 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3470  hypothetical protein  49.82 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2766  hypothetical protein  43.81 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00029608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2841  hypothetical protein  47.08 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6336  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  46.05 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1492  hypothetical protein  45.26 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0551879  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7615  hypothetical protein  45.08 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0159  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  44.56 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3065  hypothetical protein  44.37 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5701  hypothetical protein  45.32 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0748  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  43.75 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1111  hypothetical protein  44.6 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3854  hypothetical protein  44.13 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00582151  normal  0.050909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06190  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  43.82 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17610  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  40.95 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08520  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  33.15 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 523 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1638  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  32.14 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1367  Ada metal-binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 503 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  35.12 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.57 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.06 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 505 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  34.62 
 
 		 534 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  20 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3783  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 551 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  31.98 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  27.93 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0353  HhH-GPD family protein  20.1 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.26 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4163  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.813535  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  28.65 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2799  transcriptional regulator, Ada family/DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.91 
 
 		 496 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2423  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 496 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4133  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 484 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 517 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2712  transcriptional regulator, AraC family protein  27.5 
 
 		 511 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2545  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  30.93 
 
 		 581 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3395  Ada metal-binding domain protein  32.89 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0948  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  34.38 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  29.84 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  32.76 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  28.12 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 511 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1317  transcriptional regulator Ada  31.22 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238838  normal  0.620865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7756  transcriptional regulator, AraC family  61.11 
 
 		 564 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 		 565 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  28.12 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4369  AlkA domain protein  33.13 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  22.34 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0534  HhH-GPD family protein  25.95 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.723386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04780  DNA methylation and regulatory protein  29.94 
 
 		 487 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3192  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 		 497 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0100093  hitchhiker  0.000000000975834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  28.95 
 
 		 190 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1072  transcriptional regulator, AraC family  58.33 
 
 		 527 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.29 
 
 		 504 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>