103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1289 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
474 aa  929    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  41.89 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  34.78 
 
 
507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  37 
 
 
448 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  34.31 
 
 
504 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  33.47 
 
 
418 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  31.47 
 
 
509 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  34.64 
 
 
461 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  31.71 
 
 
418 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  30.77 
 
 
426 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  49.71 
 
 
439 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  34.93 
 
 
527 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  42.11 
 
 
240 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.59 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  31.07 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  33.83 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.33 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.33 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.33 
 
 
501 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.67 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  32.86 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  30.67 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  30.67 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  30.67 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  32.86 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  32.86 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  33.83 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  29.79 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  33.58 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.32 
 
 
480 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  33.08 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  30.62 
 
 
308 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  34.01 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  34.01 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  34.01 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.57 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  44.93 
 
 
236 aa  60.1  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.73 
 
 
412 aa  57.4  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.14 
 
 
251 aa  54.3  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  29.63 
 
 
787 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.08 
 
 
272 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  29.63 
 
 
842 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  37.04 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  26.74 
 
 
249 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  29.77 
 
 
260 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  30.43 
 
 
294 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  26.8 
 
 
600 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  34.44 
 
 
282 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  53.49 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.91 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  33.61 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  31.78 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  31.78 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.31 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  35.24 
 
 
263 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  29.55 
 
 
190 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  29.05 
 
 
183 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  29.55 
 
 
190 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  29.55 
 
 
190 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  30.97 
 
 
268 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  53.49 
 
 
246 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  35.53 
 
 
270 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  29.66 
 
 
334 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  31.73 
 
 
246 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  31.53 
 
 
259 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  24.5 
 
 
296 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  36.25 
 
 
371 aa  47  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  36 
 
 
254 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  29.14 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  48.98 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  51.16 
 
 
267 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  46 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  28.75 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  33.78 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  26.44 
 
 
249 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  36 
 
 
247 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  36 
 
 
247 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  35.29 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  30.84 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  26.67 
 
 
378 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  26.74 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  26.5 
 
 
264 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  32.65 
 
 
432 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  26.14 
 
 
487 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  29.05 
 
 
189 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  31.62 
 
 
286 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  34.21 
 
 
284 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  23.39 
 
 
789 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  47.73 
 
 
247 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  37.23 
 
 
225 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  30.17 
 
 
190 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>