255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1280 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 691 aa  1401    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  70.58 
 
 		 532 aa  732    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  58.3 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  36.5 
 
 		 746 aa  277  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  34.12 
 
 		 500 aa  263  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 665 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  35.32 
 
 		 530 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  34.44 
 
 		 518 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 1195 aa  238  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  33.6 
 
 		 1585 aa  237  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 		 521 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 		 508 aa  220  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  62.2 
 
 		 474 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  32.66 
 
 		 525 aa  201  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 572 aa  200  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  29.55 
 
 		 560 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.33 
 
 		 507 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  30.27 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.19 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 522 aa  178  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 536 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  60.42 
 
 		 401 aa  173  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.84 
 
 		 466 aa  173  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.54 
 
 		 562 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.93 
 
 		 1338 aa  171  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  59.72 
 
 		 495 aa  170  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.44 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  30.47 
 
 		 522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  30.13 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  52.38 
 
 		 430 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  44.71 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  43.33 
 
 		 1139 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  47.5 
 
 		 560 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.95 
 
 		 577 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  41.76 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  44.1 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.96 
 
 		 514 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.02 
 
 		 517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.95 
 
 		 476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  37.65 
 
 		 1413 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.44 
 
 		 491 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  42.75 
 
 		 411 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  44.6 
 
 		 943 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.77 
 
 		 539 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.27 
 
 		 536 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.3 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.81 
 
 		 546 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  41.5 
 
 		 647 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  25.24 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  36.88 
 
 		 392 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  29.97 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.71 
 
 		 884 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  41.06 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  42.54 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  43.85 
 
 		 618 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  37.59 
 
 		 737 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  36.09 
 
 		 963 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.25 
 
 		 512 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  38 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.09 
 
 		 558 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.52 
 
 		 957 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  24.37 
 
 		 566 aa  97.8  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  38.73 
 
 		 672 aa  97.8  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  34.93 
 
 		 230 aa  97.4  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  27.46 
 
 		 496 aa  97.4  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 636 aa  97.4  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  38.78 
 
 		 615 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  40 
 
 		 771 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  40.44 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  36.18 
 
 		 1259 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 563 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.73 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  25.24 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.04 
 
 		 507 aa  94  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.51 
 
 		 507 aa  94  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.54 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  36.23 
 
 		 897 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 581 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 503 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.97 
 
 		 2073 aa  90.5  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  23.99 
 
 		 532 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.9 
 
 		 472 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.33 
 
 		 474 aa  88.2  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.69 
 
 		 488 aa  87.4  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  25.63 
 
 		 552 aa  87.4  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.13 
 
 		 523 aa  87.4  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  37.14 
 
 		 789 aa  87.4  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  24.28 
 
 		 539 aa  87.4  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  37.86 
 
 		 510 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.75 
 
 		 695 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>