More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1092 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 310 aa  591  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.45 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  51.59 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  56.96 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  46.13 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  52.37 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  46.57 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  50.93 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  44.12 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  47.29 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  43.64 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  40.58 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  43.14 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  43.26 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  45.12 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  45.79 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  42.95 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  41.39 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  46.23 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  45.68 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  45.88 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  41.61 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  42.01 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  45.39 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  44.48 
 
 		 329 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  40.07 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  39.26 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  40.33 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  40.33 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  40.33 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  35.67 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  32.32 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  44.4 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  38.06 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  41.75 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  37.38 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  40.89 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  30.21 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  28.71 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.23 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.07 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.23 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  29.41 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.04 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.73 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  28.62 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  32.49 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.47 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.67 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.35 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  31.37 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  30.93 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  31.37 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  30.12 
 
 		 918 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  24.92 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.1 
 
 		 280 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.38 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  32.51 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  30.99 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  27.72 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  29.97 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  30.26 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  28.47 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  28.47 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  29.76 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  28.47 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  32.27 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  31.8 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  30.27 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  26.42 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  29.08 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  26.95 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  26.95 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  28.76 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  28.07 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  28.07 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.21 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  28.07 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  28.07 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  27.68 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  31.86 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  27.68 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  45.79 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  27.68 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  27.68 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  27.68 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  26.76 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  28.38 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  25.44 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  26.48 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  26.48 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>