More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0987 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  68.51 
 
 		 613 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  50.86 
 
 		 614 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0480  GTP-binding protein TypA  69.75 
 
 		 641 aa  902    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 645 aa  1293    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  80.06 
 
 		 636 aa  1018    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  72.49 
 
 		 650 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  72.48 
 
 		 617 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  88.96 
 
 		 636 aa  1152    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1122  GTP-binding protein TypA  84.54 
 
 		 633 aa  1049    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1144  GTP-binding protein TypA  68.2 
 
 		 635 aa  822    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  71.97 
 
 		 629 aa  931    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  66.09 
 
 		 629 aa  847    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0759  GTP-binding protein TypA  69.46 
 
 		 633 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  70.32 
 
 		 620 aa  881    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  86.47 
 
 		 635 aa  1098    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  69.04 
 
 		 620 aa  882    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3331  GTP-binding protein TypA  67.03 
 
 		 636 aa  822    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0962  GTP-binding protein TypA  88.12 
 
 		 645 aa  1116    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0622618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  81.99 
 
 		 642 aa  1050    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.13 
 
 		 608 aa  679    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2163  GTP-binding protein TypA  66.98 
 
 		 642 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4269  GTP-binding protein TypA  68.11 
 
 		 633 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  68.02 
 
 		 624 aa  870    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 		 605 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  73.67 
 
 		 617 aa  919    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  72.25 
 
 		 630 aa  934    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4040  GTP-binding protein TypA  68.11 
 
 		 633 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0578  GTP-binding protein TypA  56.43 
 
 		 609 aa  660    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0310674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  72.73 
 
 		 641 aa  927    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  65.99 
 
 		 620 aa  831    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  73.39 
 
 		 617 aa  930    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  70.65 
 
 		 640 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  72.76 
 
 		 622 aa  912    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  72.09 
 
 		 630 aa  932    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11090  GTP-binding protein TypA/BipA  80.7 
 
 		 640 aa  1037    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11190  GTP-binding translation elongation factor typA  65.97 
 
 		 628 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0246  membrane GTPase for stress response  69.4 
 
 		 643 aa  919    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.107779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  81.92 
 
 		 642 aa  1053    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  54.28 
 
 		 594 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  56.38 
 
 		 608 aa  695    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  75.31 
 
 		 630 aa  952    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  75.39 
 
 		 631 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4115  GTP-binding protein TypA  68.11 
 
 		 633 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4540  GTP-binding protein TypA  66.61 
 
 		 634 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  50.32 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 		 593 aa  619  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  50.32 
 
 		 606 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.29 
 
 		 616 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  50.39 
 
 		 612 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  51.6 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  48.9 
 
 		 615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  50.63 
 
 		 616 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  48.66 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  48.66 
 
 		 610 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  49.29 
 
 		 614 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  50.79 
 
 		 615 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  49.45 
 
 		 614 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  50.16 
 
 		 615 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  49.29 
 
 		 614 aa  598  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  50.79 
 
 		 615 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  49.84 
 
 		 602 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  51.36 
 
 		 595 aa  598  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  48.97 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  50.63 
 
 		 615 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  48.49 
 
 		 608 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  50.47 
 
 		 613 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  48.75 
 
 		 613 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  47.96 
 
 		 615 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  50.16 
 
 		 595 aa  588  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 592 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  47.96 
 
 		 615 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  49.21 
 
 		 613 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  48.8 
 
 		 610 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  47.92 
 
 		 602 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  47.52 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  47.92 
 
 		 602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  48.04 
 
 		 613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  49.28 
 
 		 598 aa  582  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  49.05 
 
 		 627 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  48.14 
 
 		 600 aa  579  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  48.87 
 
 		 613 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  48.9 
 
 		 613 aa  581  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  46.87 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  46.34 
 
 		 603 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  49.21 
 
 		 632 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  48.04 
 
 		 608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  48.57 
 
 		 601 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  49.44 
 
 		 614 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 		 619 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  48.08 
 
 		 601 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>