More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0955 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  100 
 
 
240 aa  460  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  68.3 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2803  ABC transporter related protein  63.98 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  52.47 
 
 
252 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.22 
 
 
232 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1555  ABC transporter related  61.32 
 
 
239 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  51.75 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  51.09 
 
 
565 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  52.49 
 
 
233 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
233 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
233 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
233 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0180  ABC transporter related  52.49 
 
 
231 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0585319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  54.09 
 
 
238 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
233 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  51.82 
 
 
237 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
233 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
233 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
233 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.6 
 
 
239 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.05 
 
 
252 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  49.32 
 
 
249 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  47.11 
 
 
244 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.78 
 
 
255 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.54 
 
 
230 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
228 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 
233 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.2 
 
 
649 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.2 
 
 
649 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
244 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  45.62 
 
 
234 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  48.89 
 
 
229 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.05 
 
 
238 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.96 
 
 
240 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.96 
 
 
240 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
240 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
253 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  46.15 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.75 
 
 
644 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.09 
 
 
652 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.96 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  48.57 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.78 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  44.8 
 
 
227 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  51.14 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.11 
 
 
653 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.41 
 
 
235 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  49.34 
 
 
563 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.98 
 
 
259 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
238 aa  197  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.45 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  47.73 
 
 
654 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  50.67 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.41 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  47.44 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  49.34 
 
 
650 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  52.53 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.11 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  47.06 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.27 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  42.53 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  49.02 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.75 
 
 
241 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 
648 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.39 
 
 
227 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 
648 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.27 
 
 
648 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  48.44 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
312 aa  195  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  49.09 
 
 
233 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
643 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  43.58 
 
 
228 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.8 
 
 
241 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.23 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  42.08 
 
 
241 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  48.43 
 
 
252 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.44 
 
 
455 aa  194  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.48 
 
 
249 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  49.54 
 
 
246 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  48.88 
 
 
231 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3477  ABC transporter related  52.31 
 
 
231 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
222 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.63 
 
 
241 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.05 
 
 
277 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.59 
 
 
235 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.59 
 
 
228 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45.58 
 
 
258 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>