More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0890 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  100 
 
 		 2066 aa  4039    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  40.59 
 
 		 1565 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  41.6 
 
 		 1150 aa  553  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.62 
 
 		 1916 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  34.21 
 
 		 1009 aa  335  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  47.57 
 
 		 890 aa  168  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  52.54 
 
 		 816 aa  157  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  43.75 
 
 		 623 aa  143  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  46.56 
 
 		 1057 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  46.7 
 
 		 623 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.53 
 
 		 574 aa  132  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  41.62 
 
 		 792 aa  127  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  39.11 
 
 		 873 aa  116  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.62 
 
 		 1667 aa  113  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.52 
 
 		 752 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  30.61 
 
 		 1356 aa  109  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  43.82 
 
 		 3197 aa  108  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.02 
 
 		 773 aa  106  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  35.1 
 
 		 1027 aa  105  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  39.53 
 
 		 944 aa  103  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  47.06 
 
 		 943 aa  102  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  38.41 
 
 		 948 aa  101  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.37 
 
 		 1094 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 940 aa  101  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.23 
 
 		 1862 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  40.44 
 
 		 517 aa  101  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  39.63 
 
 		 944 aa  99  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  43.06 
 
 		 938 aa  98.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 3295 aa  99  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.02 
 
 		 944 aa  97.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  38.95 
 
 		 948 aa  97.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.41 
 
 		 944 aa  97.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  39.02 
 
 		 944 aa  97.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  38.37 
 
 		 948 aa  97.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.38 
 
 		 1236 aa  96.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.29 
 
 		 1842 aa  96.3  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  31.27 
 
 		 918 aa  96.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.33 
 
 		 2272 aa  95.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.19 
 
 		 1732 aa  94  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  24.52 
 
 		 1528 aa  94.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  24.55 
 
 		 978 aa  94  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.66 
 
 		 2036 aa  93.2  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.26 
 
 		 947 aa  92.8  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  37.79 
 
 		 948 aa  92.8  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  38.79 
 
 		 775 aa  92.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.72 
 
 		 1300 aa  92  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  34.34 
 
 		 713 aa  90.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.68 
 
 		 679 aa  90.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1667 aa  90.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  48.91 
 
 		 677 aa  90.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  30.2 
 
 		 791 aa  90.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  66.67 
 
 		 606 aa  90.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 561 aa  89.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 		 1606 aa  89.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  28.35 
 
 		 859 aa  89  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  22.77 
 
 		 1620 aa  88.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  25.77 
 
 		 1814 aa  88.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  31.94 
 
 		 1120 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  50.41 
 
 		 734 aa  88.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  40.36 
 
 		 3197 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 		 942 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  41.78 
 
 		 951 aa  86.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.45 
 
 		 675 aa  86.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  33.14 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  45.9 
 
 		 935 aa  85.9  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  33.89 
 
 		 2176 aa  85.9  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.56 
 
 		 2554 aa  85.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  36.18 
 
 		 552 aa  85.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1682 aa  85.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  38.97 
 
 		 317 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  47.37 
 
 		 777 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  37.43 
 
 		 910 aa  84.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  30.6 
 
 		 685 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.82 
 
 		 547 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  40 
 
 		 780 aa  84.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  32.56 
 
 		 618 aa  84  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  33.18 
 
 		 661 aa  84  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  40.12 
 
 		 917 aa  83.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.57 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  53.49 
 
 		 712 aa  82.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.72 
 
 		 669 aa  82.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  50.56 
 
 		 778 aa  82.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.1 
 
 		 1602 aa  82.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.58 
 
 		 11716 aa  82  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  47.47 
 
 		 778 aa  82  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.16 
 
 		 713 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.78 
 
 		 658 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  30.34 
 
 		 184 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  34.24 
 
 		 1556 aa  82  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  33.14 
 
 		 1241 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.29 
 
 		 1969 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.62 
 
 		 1882 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.5 
 
 		 2122 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  29.1 
 
 		 551 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  47.47 
 
 		 778 aa  82  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.3 
 
 		 519 aa  82  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  47.47 
 
 		 778 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  40 
 
 		 995 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  34.48 
 
 		 615 aa  81.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  44.26 
 
 		 965 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>