More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0862 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 357 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  38.08 
 
 		 436 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 416 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  44.75 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  38.21 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 473 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.07 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  35.81 
 
 		 467 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.08 
 
 		 448 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  42.22 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  40.54 
 
 		 403 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  38.72 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  37.86 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  39.61 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  36.27 
 
 		 370 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.21 
 
 		 425 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  39.74 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.86 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  39.93 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 483 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 469 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.18 
 
 		 362 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  37.34 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  42.56 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  39.04 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  37 
 
 		 466 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 467 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  33.89 
 
 		 592 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.55 
 
 		 463 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  37.28 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  38.77 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  38.41 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.77 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  34.74 
 
 		 463 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.39 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 490 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.33 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.09 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  35.97 
 
 		 518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 477 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  35.51 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 517 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 484 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 479 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.33 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 460 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 487 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 406 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 495 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.46 
 
 		 447 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  39.39 
 
 		 476 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  30 
 
 		 472 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  34.35 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.22 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  36.67 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 447 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.52 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  33.56 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  33.67 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 469 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 475 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>