More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0767 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  290  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  58.46 
 
 
143 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  55.64 
 
 
158 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  50.34 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  46.9 
 
 
156 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  41.61 
 
 
144 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
151 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
139 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
143 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
146 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
141 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.78 
 
 
151 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
143 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  41.04 
 
 
163 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  42.65 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  41.51 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  45.69 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 
183 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.43 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
146 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  35.61 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.84 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.29 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.45 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
172 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>