More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0638 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  65.97 
 
 		 1215 aa  1105    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  55.24 
 
 		 1331 aa  890    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  53.15 
 
 		 1146 aa  847    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1780 aa  3551    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  38.97 
 
 		 1242 aa  522  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  39.03 
 
 		 1019 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.79 
 
 		 1018 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.48 
 
 		 1059 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.37 
 
 		 1059 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.08 
 
 		 1020 aa  360  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  30.68 
 
 		 1037 aa  355  5.9999999999999994e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  30.89 
 
 		 1041 aa  352  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.98 
 
 		 690 aa  337  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  39.74 
 
 		 912 aa  332  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.75 
 
 		 1050 aa  244  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.9 
 
 		 697 aa  227  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.2 
 
 		 1495 aa  206  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.78 
 
 		 619 aa  200  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 		 689 aa  200  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.17 
 
 		 1478 aa  198  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.94 
 
 		 756 aa  197  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.42 
 
 		 366 aa  181  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  35.94 
 
 		 331 aa  181  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  46.24 
 
 		 364 aa  170  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 		 407 aa  170  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.26 
 
 		 337 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  31.3 
 
 		 324 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.43 
 
 		 323 aa  163  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 1077 aa  162  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  35.07 
 
 		 338 aa  158  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.83 
 
 		 359 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  45.55 
 
 		 321 aa  156  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.48 
 
 		 321 aa  155  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  43.92 
 
 		 244 aa  154  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 		 202 aa  153  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0141  polysaccharide deacetylase  44.39 
 
 		 216 aa  152  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 		 423 aa  152  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  33.84 
 
 		 371 aa  146  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  47.03 
 
 		 1327 aa  144  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  35.67 
 
 		 328 aa  142  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.56 
 
 		 374 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  34.53 
 
 		 543 aa  142  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  33.52 
 
 		 488 aa  140  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.04 
 
 		 474 aa  136  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  33.99 
 
 		 477 aa  136  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 628 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.1 
 
 		 382 aa  134  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.42 
 
 		 491 aa  131  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 837 aa  128  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  30.51 
 
 		 2457 aa  127  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.57 
 
 		 497 aa  127  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  38.57 
 
 		 215 aa  125  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.48 
 
 		 347 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  25.17 
 
 		 806 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  28.48 
 
 		 347 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 815 aa  123  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.87 
 
 		 369 aa  123  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  32.29 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  32.81 
 
 		 394 aa  120  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  33.53 
 
 		 383 aa  120  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  30.29 
 
 		 503 aa  119  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  32.95 
 
 		 333 aa  119  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  27.01 
 
 		 423 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  33.02 
 
 		 398 aa  117  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 451 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.14 
 
 		 474 aa  116  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  32 
 
 		 399 aa  117  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.49 
 
 		 373 aa  116  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 		 370 aa  116  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.52 
 
 		 778 aa  115  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.21 
 
 		 1001 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.3 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  34.27 
 
 		 691 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  31.85 
 
 		 472 aa  113  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  30.59 
 
 		 388 aa  113  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.96 
 
 		 495 aa  113  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.58 
 
 		 829 aa  113  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  31.19 
 
 		 820 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.89 
 
 		 457 aa  113  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  27.55 
 
 		 487 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.88 
 
 		 317 aa  110  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 		 454 aa  110  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  28.19 
 
 		 619 aa  110  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 678 aa  110  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 639 aa  110  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  27.29 
 
 		 463 aa  109  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  24.8 
 
 		 364 aa  108  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  31.37 
 
 		 457 aa  107  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  31.17 
 
 		 451 aa  105  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.19 
 
 		 756 aa  103  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 283 aa  103  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  32.42 
 
 		 370 aa  100  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 219 aa  99.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.43 
 
 		 317 aa  99.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  28.24 
 
 		 520 aa  99  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  25.07 
 
 		 387 aa  99  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 284 aa  98.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.55 
 
 		 309 aa  97.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.45 
 
 		 389 aa  97.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.76 
 
 		 285 aa  95.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>