72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0551 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 335 aa  664    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  53.05 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  52.5 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  54.43 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  50.79 
 
 		 383 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  50.48 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  53.82 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.79 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  49.51 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.94 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.68 
 
 		 320 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  45.19 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  33.99 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.22 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  33.54 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  32.58 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.02 
 
 		 444 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  31.55 
 
 		 533 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  28.12 
 
 		 509 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.49 
 
 		 618 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.45 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  29.5 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  29.1 
 
 		 468 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  28.71 
 
 		 524 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  27.51 
 
 		 679 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  28.27 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.52 
 
 		 1186 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 1338 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.71 
 
 		 527 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  26.34 
 
 		 667 aa  87  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.15 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  26.49 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.08 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  23.8 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.51 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.63 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 319 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.89 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  28.08 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  28.53 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  26.52 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.55 
 
 		 829 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.55 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  22.84 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 532 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 		 586 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.42 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.4 
 
 		 551 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>