More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0549 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  69.96 
 
 		 263 aa  384  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  72.52 
 
 		 263 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  68.44 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  64.37 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3155  exodeoxyribonuclease III Xth  60.13 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  65.4 
 
 		 266 aa  351  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  65.27 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  62.41 
 
 		 294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  62.64 
 
 		 291 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  64.44 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  62.07 
 
 		 275 aa  331  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  60.07 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  62.5 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  59.77 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  59.32 
 
 		 264 aa  318  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  59.25 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  59.25 
 
 		 267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  58.87 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  58.61 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  57.58 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  58.18 
 
 		 275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  54.72 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  55.77 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  55.38 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  53.64 
 
 		 259 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  54.2 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  55.64 
 
 		 297 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  48.4 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  48.86 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  45.11 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  47.53 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  41.7 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.19 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  42.15 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  42.26 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.67 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  42.26 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  40.93 
 
 		 256 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  41.67 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  41.29 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  40.77 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  41.22 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  44.7 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  40.68 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.73 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  38.11 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 260 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  39.53 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  38.76 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  42.11 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  42.48 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  40.23 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  42.11 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  39.54 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 281 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  38.87 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  40.6 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  38.17 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  37.93 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  32.83 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  39.62 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  40.84 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  32.95 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  37.74 
 
 		 264 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  38.37 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  40.08 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  37.36 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  39.1 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>