100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0505 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  100 
 
 
407 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  43.32 
 
 
407 aa  223  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  39.39 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  40.39 
 
 
388 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  40 
 
 
420 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  42.25 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  37.47 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  42 
 
 
414 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  39.46 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  39.39 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  41 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  36.9 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  36.58 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  39.43 
 
 
405 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  36.09 
 
 
392 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  36.7 
 
 
432 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  38.23 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  35.29 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  33.51 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  36.93 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  34.3 
 
 
399 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  34.58 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  35.22 
 
 
384 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  36.32 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  48.18 
 
 
407 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  51.35 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.37 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  26.97 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  26.97 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.63 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  23.08 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.02 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  24.01 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  29.25 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.8 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  28.61 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  26 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.05 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  26.84 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  22.85 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.91 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.09 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  24.57 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.82 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  25.31 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.6 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.22 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  30.72 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  30.25 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  30.07 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  30.34 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  26.29 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  27.11 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  30.25 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  30.34 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  30.25 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  33.08 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  27.85 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  32.67 
 
 
459 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  27.27 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  27.45 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  29.67 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  21.72 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  25.45 
 
 
391 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  29.67 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.77 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  28.57 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  32.33 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  30.71 
 
 
405 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  32.03 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  32.03 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  19.29 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  28.68 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  29.12 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  24.35 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  29.12 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  23.99 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  23.99 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  25.38 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  27.61 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  18.72 
 
 
398 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  27.91 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  23.39 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  27.76 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  31.25 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  27.91 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  32.58 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  26.33 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  25.94 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  26.43 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  32.58 
 
 
398 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>