206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0456 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  100 
 
 
568 aa  1162    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  51.02 
 
 
548 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  48.82 
 
 
597 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  42.41 
 
 
535 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.48 
 
 
567 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  40.82 
 
 
558 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  38.49 
 
 
574 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  38.22 
 
 
547 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  41.76 
 
 
541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  41.12 
 
 
408 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  43.71 
 
 
407 aa  310  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  41.88 
 
 
403 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  42.6 
 
 
413 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
604 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  41.49 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  38.04 
 
 
408 aa  286  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  40.31 
 
 
387 aa  283  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  40.05 
 
 
399 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  42.04 
 
 
693 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  37.6 
 
 
411 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.39 
 
 
589 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  36.76 
 
 
727 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.28 
 
 
850 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  35.09 
 
 
535 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  30.7 
 
 
533 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  32.48 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.54 
 
 
677 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  30.81 
 
 
532 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  31.4 
 
 
658 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  32.35 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.28 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  32.88 
 
 
631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.09 
 
 
640 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  34.04 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.79 
 
 
441 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.91 
 
 
612 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  27.75 
 
 
636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  33.75 
 
 
320 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  28.16 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  25.96 
 
 
446 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  25.56 
 
 
737 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  54.69 
 
 
469 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.44 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.96 
 
 
587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  26.1 
 
 
433 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  52.55 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  54.84 
 
 
489 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  51.61 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.76 
 
 
442 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  53.6 
 
 
374 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  29.32 
 
 
427 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.59 
 
 
493 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  48.41 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  46.31 
 
 
801 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.2 
 
 
498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  44.38 
 
 
490 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.8 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  48.31 
 
 
497 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  49.6 
 
 
451 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.74 
 
 
435 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  42.86 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  49.21 
 
 
472 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  48.28 
 
 
801 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 
1072 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  40.26 
 
 
801 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  48.41 
 
 
461 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  26.21 
 
 
450 aa  103  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25.93 
 
 
440 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  41.67 
 
 
634 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  26.27 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.53 
 
 
373 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  24.52 
 
 
445 aa  99.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  37.5 
 
 
492 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  45.9 
 
 
468 aa  97.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.33 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  41.46 
 
 
803 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.6 
 
 
933 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  46.61 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  40.3 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 
391 aa  91.3  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  39.67 
 
 
426 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40.15 
 
 
417 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  40.34 
 
 
452 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  42.48 
 
 
1207 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  42.15 
 
 
732 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  39.67 
 
 
890 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 
709 aa  87.8  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  46.08 
 
 
1128 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.94 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.14 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.98 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  40.68 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  35.71 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  38.81 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  36.21 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.28 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.17 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  20.6 
 
 
1172 aa  70.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.56 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>