58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0431 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  45.13 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  45.18 
 
 
268 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  41.03 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  38.71 
 
 
164 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  37.26 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  35.38 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  40.14 
 
 
234 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  28.35 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  28.35 
 
 
220 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  27.84 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  28.87 
 
 
223 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  36.69 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  27.32 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  27.32 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  27.84 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  27.32 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  33.87 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  25.13 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  25.13 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  34.05 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  26.13 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  23.74 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  25.13 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  25.13 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  23.74 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.74 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.74 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  23.74 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  26.32 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  24.12 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.91 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  23.63 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.14 
 
 
321 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.74 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  34.74 
 
 
105 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  28.16 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  28.88 
 
 
204 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  29.51 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  21.84 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  22.44 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  28.67 
 
 
313 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  28.05 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  30.39 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  36.73 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  31.55 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  29.76 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  28.28 
 
 
333 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.72 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  29.56 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  31.18 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  30.67 
 
 
190 aa  42  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  25.69 
 
 
334 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  26.04 
 
 
313 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  28.18 
 
 
185 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  28.18 
 
 
185 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.12 
 
 
315 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  34.09 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>