73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0308 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  40.1 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  38.65 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  29.81 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  50.85 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  29.44 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 182 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 185 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 234 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 248 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>