191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0124 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  47.64 
 
 		 1047 aa  691    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  100 
 
 		 1046 aa  1941    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.29 
 
 		 1039 aa  287  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.62 
 
 		 1049 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.66 
 
 		 1029 aa  263  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  23.41 
 
 		 1029 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.75 
 
 		 1029 aa  258  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  26.85 
 
 		 1018 aa  257  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.25 
 
 		 1029 aa  257  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.06 
 
 		 1029 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.06 
 
 		 1029 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  24.25 
 
 		 1029 aa  254  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.06 
 
 		 1029 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  50.6 
 
 		 1022 aa  241  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  19.22 
 
 		 1009 aa  219  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  39.78 
 
 		 995 aa  206  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  40.84 
 
 		 986 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  38.08 
 
 		 1023 aa  181  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  46.32 
 
 		 986 aa  181  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  41 
 
 		 881 aa  174  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  46.53 
 
 		 962 aa  172  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  37.81 
 
 		 995 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  53.63 
 
 		 1291 aa  165  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.83 
 
 		 1018 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  53.01 
 
 		 1025 aa  160  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.62 
 
 		 1013 aa  160  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  44.88 
 
 		 989 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  46.41 
 
 		 953 aa  159  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.31 
 
 		 1018 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  35.45 
 
 		 1018 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  47.86 
 
 		 1249 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.67 
 
 		 1018 aa  155  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1018 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  27.64 
 
 		 1018 aa  153  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  36.55 
 
 		 1018 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  36.55 
 
 		 1018 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  35.51 
 
 		 1018 aa  151  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  36.84 
 
 		 1020 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  34.53 
 
 		 1020 aa  147  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  39.9 
 
 		 1029 aa  147  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  39.9 
 
 		 1029 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  39.9 
 
 		 1029 aa  147  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  33.74 
 
 		 1081 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  36.82 
 
 		 1018 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  36.07 
 
 		 1018 aa  145  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 1038 aa  144  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  39.67 
 
 		 1020 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.53 
 
 		 1059 aa  140  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  48.19 
 
 		 1009 aa  139  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  34.8 
 
 		 1009 aa  134  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  34.8 
 
 		 1009 aa  134  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  49.73 
 
 		 1191 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  53.37 
 
 		 1058 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  47.95 
 
 		 1017 aa  131  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 		 1033 aa  131  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  39.81 
 
 		 810 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.55 
 
 		 1018 aa  125  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.15 
 
 		 1030 aa  124  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.65 
 
 		 1091 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  36.65 
 
 		 1024 aa  121  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  34.5 
 
 		 1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.13 
 
 		 1091 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.97 
 
 		 1011 aa  115  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  34.18 
 
 		 1114 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  22.21 
 
 		 1219 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  20.75 
 
 		 1108 aa  108  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  37.17 
 
 		 1223 aa  105  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  32.51 
 
 		 1088 aa  105  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  34.6 
 
 		 1165 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  45.3 
 
 		 1006 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  36.05 
 
 		 1223 aa  104  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  37.18 
 
 		 1085 aa  101  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  32.34 
 
 		 1116 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30.64 
 
 		 1223 aa  99.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.47 
 
 		 1180 aa  100  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31.66 
 
 		 1172 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.22 
 
 		 1224 aa  99  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  38.12 
 
 		 1230 aa  98.6  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.96 
 
 		 1172 aa  98.2  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  31.68 
 
 		 1155 aa  98.2  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.22 
 
 		 1346 aa  97.8  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  28.18 
 
 		 1137 aa  97.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  35.03 
 
 		 1307 aa  95.9  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  35.03 
 
 		 1303 aa  95.1  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  30.22 
 
 		 1164 aa  95.5  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  29.24 
 
 		 1226 aa  95.1  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  37.19 
 
 		 910 aa  94.7  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  29.55 
 
 		 950 aa  94  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  39.1 
 
 		 906 aa  93.2  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  31.14 
 
 		 1226 aa  92.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.34 
 
 		 1234 aa  92  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  34.45 
 
 		 824 aa  91.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.22 
 
 		 1046 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  28.22 
 
 		 1046 aa  89.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  28.22 
 
 		 1046 aa  89  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  30.62 
 
 		 1165 aa  89  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  29.13 
 
 		 1265 aa  88.6  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  28.22 
 
 		 1046 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>