More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0088 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 193 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  49.42 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  36.51 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 235 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 269 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  37.11 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 224 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  28.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.24 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  29.09 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.24 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  18.59 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>