35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0069 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0069  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
348 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00693904 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  48.15 
 
 
551 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  53.49 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  43.96 
 
 
456 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  48.84 
 
 
778 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.13 
 
 
2272 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  49.37 
 
 
555 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.58 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.1 
 
 
1888 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  43.14 
 
 
840 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  57.63 
 
 
613 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.45 
 
 
830 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  46.27 
 
 
1281 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  46.81 
 
 
2353 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  41.67 
 
 
522 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  38.57 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  40.62 
 
 
1217 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.68 
 
 
2313 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  55.56 
 
 
488 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  43.48 
 
 
572 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  35.37 
 
 
489 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.17 
 
 
916 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  57.14 
 
 
489 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  53.06 
 
 
472 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  55.93 
 
 
611 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  49.38 
 
 
501 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  40.37 
 
 
489 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  55.93 
 
 
611 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33.71 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1258  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
745 aa  43.9  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  39.66 
 
 
1409 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.88 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  31.64 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>