30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0067 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 
391 aa  757    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  51.36 
 
 
384 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  35.47 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  31.3 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  42.22 
 
 
388 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  34.2 
 
 
489 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  37.81 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  39.42 
 
 
389 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  36.25 
 
 
358 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  35.74 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  33.44 
 
 
833 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  33.16 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  33.55 
 
 
516 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  29.75 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  37.3 
 
 
288 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  36.26 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  38.32 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  33.1 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  44.88 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  39.69 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  29.88 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  38.73 
 
 
260 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  47.41 
 
 
364 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  24.4 
 
 
312 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  27.01 
 
 
2169 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3556  hypothetical protein  29.19 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1182  hypothetical protein  44.62 
 
 
71 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.527432  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  28.39 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  23.81 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3240  hypothetical protein  26.52 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0144295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>