184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0056 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
329 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  36.11 
 
 
329 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
328 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  37.02 
 
 
298 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
300 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  29.05 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
342 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
330 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  28.06 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  28.01 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
318 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  28.38 
 
 
227 aa  55.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  25.89 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.02 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  33.51 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.42 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  38.98 
 
 
216 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  33.08 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.35 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  27.71 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  22.16 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.39 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.13 
 
 
366 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  24.55 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
501 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
375 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0750302  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  31.43 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.23 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  29.1 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  31.79 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  23.39 
 
 
328 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
261 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
338 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  25.23 
 
 
297 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.23 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  25.23 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.26 
 
 
292 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  25.23 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.69 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.77 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>