234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0054 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  68.25 
 
 
219 aa  228  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  54.41 
 
 
210 aa  198  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  51.72 
 
 
213 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  52.88 
 
 
209 aa  184  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  43.56 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  49.09 
 
 
213 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  45.24 
 
 
212 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.05 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  44.64 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  43.45 
 
 
211 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  40.2 
 
 
208 aa  171  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.45 
 
 
211 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  43.45 
 
 
211 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  43.45 
 
 
211 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.45 
 
 
211 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  43.45 
 
 
211 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  43.45 
 
 
211 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  43.45 
 
 
211 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  49.74 
 
 
209 aa  167  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  51.45 
 
 
212 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  54.63 
 
 
233 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  41.71 
 
 
214 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  39.18 
 
 
211 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  52.5 
 
 
199 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  43.9 
 
 
212 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.52 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  50 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  50 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  50 
 
 
232 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  36.41 
 
 
213 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  43.55 
 
 
214 aa  141  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.35 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.23 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.71 
 
 
221 aa  138  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.93 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  35.57 
 
 
219 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  39.06 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.5 
 
 
208 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  40.46 
 
 
207 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.17 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.17 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.17 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.62 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  29.9 
 
 
212 aa  125  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.85 
 
 
205 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  40.46 
 
 
204 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  39.66 
 
 
207 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  39.55 
 
 
204 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  32.67 
 
 
207 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  41.4 
 
 
225 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  39.43 
 
 
204 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  37.95 
 
 
216 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  52.94 
 
 
206 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  41.04 
 
 
204 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  39.09 
 
 
204 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  39.27 
 
 
203 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  35.68 
 
 
204 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  38.97 
 
 
203 aa  121  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  40.23 
 
 
212 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.34 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  39.71 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  41.21 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.76 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  53.06 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.03 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  40.31 
 
 
211 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  37.22 
 
 
213 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  37.22 
 
 
213 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  36.59 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  50.38 
 
 
242 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  35.87 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  40.51 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4183  protein of unknown function UPF0029  61.59 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  40.61 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  33.5 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  37.36 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  42.22 
 
 
274 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  35.4 
 
 
200 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  37.36 
 
 
204 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  44.52 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  39.38 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  30.86 
 
 
203 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  34.17 
 
 
204 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.57 
 
 
206 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  35.03 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.63 
 
 
194 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  45.45 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  37.16 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.13 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  32.62 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.61 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  33.67 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  37.82 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.57 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>