More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0053 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  68.57 
 
 
542 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0452  ABC transporter related  69.17 
 
 
544 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0053  ABC transporter related protein  100 
 
 
548 aa  1070    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  66.91 
 
 
555 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  68.26 
 
 
545 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  66.97 
 
 
545 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4164  ABC transporter related protein  67.46 
 
 
544 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0507  ABC transporter related protein  66.61 
 
 
549 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  60.99 
 
 
553 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.8 
 
 
550 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  62.66 
 
 
548 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  60.58 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  60.58 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  61.31 
 
 
569 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  60.58 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  61.09 
 
 
550 aa  601  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  59.13 
 
 
554 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  58.95 
 
 
551 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2670  ABC transporter related  59.17 
 
 
537 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  52.44 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5697  ABC transporter related protein  43.99 
 
 
543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  35.89 
 
 
567 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  33.15 
 
 
552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.82 
 
 
634 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.58 
 
 
575 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.58 
 
 
564 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.71 
 
 
581 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.32 
 
 
564 aa  274  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.33 
 
 
672 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.3 
 
 
690 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.41 
 
 
709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.68 
 
 
639 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.77 
 
 
569 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.71 
 
 
668 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.29 
 
 
636 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 
536 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  35.66 
 
 
574 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.86 
 
 
643 aa  246  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.41 
 
 
630 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.29 
 
 
541 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  30.71 
 
 
540 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  32.91 
 
 
879 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 
545 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  32.74 
 
 
547 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  31.36 
 
 
640 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  33.87 
 
 
583 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.09 
 
 
548 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.7 
 
 
540 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  33.7 
 
 
540 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.15 
 
 
543 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.21 
 
 
543 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.05 
 
 
659 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  33.81 
 
 
574 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.09 
 
 
541 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.25 
 
 
644 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  32.05 
 
 
658 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 
548 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.33 
 
 
548 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
644 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
644 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
658 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
658 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
662 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
640 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
641 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
658 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.79 
 
 
544 aa  236  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.58 
 
 
620 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 
658 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  35.56 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  29.64 
 
 
572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.81 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
632 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.32 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.44 
 
 
642 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.11 
 
 
666 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.44 
 
 
642 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 
545 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.82 
 
 
639 aa  232  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  33.09 
 
 
767 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.6 
 
 
645 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  32.19 
 
 
575 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  31.45 
 
 
540 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
551 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  34.38 
 
 
659 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.5 
 
 
540 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.65 
 
 
649 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.44 
 
 
549 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  30.84 
 
 
518 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 
636 aa  230  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  30.21 
 
 
545 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  32.08 
 
 
542 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.61 
 
 
634 aa  229  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  30.51 
 
 
646 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.58 
 
 
545 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 
518 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.68 
 
 
636 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
663 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.48 
 
 
685 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>