More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0052 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0052  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
326 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3739  regulatory protein LacI  60.98 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160393  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1835  LacI family transcription regulator  38.17 
 
 
336 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3835  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 
329 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3909  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 
329 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3194  LacI family transcription regulator  39.1 
 
 
331 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2415  transcriptional regulator, LacI family  34.54 
 
 
346 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.80536  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3821  LacI family transcription regulator  38.72 
 
 
329 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215608  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0448  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2529  regulatory protein LacI  35.29 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 
349 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
352 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  29.43 
 
 
332 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  29.43 
 
 
332 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 
362 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  33.03 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 
348 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.47 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.47 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 
334 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
334 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.14 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 
343 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 
353 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 
336 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 
358 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 
355 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.73 
 
 
331 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4264  alanine racemase  33.97 
 
 
343 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.884026  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 
340 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 
328 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 
344 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 
334 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.06 
 
 
339 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257344  hitchhiker  0.000000000070204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 
351 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 
336 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2793  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 
321 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  30.16 
 
 
340 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 
337 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  36.82 
 
 
338 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 
349 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.17 
 
 
339 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.66 
 
 
337 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 
344 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2762  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 
339 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.78 
 
 
339 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 
335 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  30.94 
 
 
332 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  30.57 
 
 
340 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 
333 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 
368 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 
336 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 
340 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  33.79 
 
 
350 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 
663 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 
351 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 
344 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  25.56 
 
 
332 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  37.54 
 
 
346 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 
350 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 
343 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4566  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  36.86 
 
 
339 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 
366 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.07 
 
 
331 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.05 
 
 
332 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3708  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  30.69 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.91 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.81 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  35.43 
 
 
341 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  28.38 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.41 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.05 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  26.89 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0629  LacI family transcriptional regulator  36.61 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  30.36 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.62 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  35.58 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  29.31 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.96 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  32.11 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0795  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.9 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5102  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>