More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0002 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 376 aa  741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  82.98 
 
 		 376 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  80.59 
 
 		 377 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  78.46 
 
 		 376 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  70.9 
 
 		 378 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  66.13 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.76 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.76 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  61.5 
 
 		 374 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  60 
 
 		 378 aa  441  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.74 
 
 		 379 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  58.16 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  56.53 
 
 		 374 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  56.73 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  58.36 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  58.47 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.21 
 
 		 396 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.17 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  52.49 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  48.13 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.25 
 
 		 402 aa  359  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  53.68 
 
 		 377 aa  358  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  50.8 
 
 		 365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.68 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.68 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.19 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  51.43 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  50.65 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.4 
 
 		 380 aa  348  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.65 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.31 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  51.98 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.31 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  48.31 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.93 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  44.39 
 
 		 374 aa  344  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.16 
 
 		 388 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  47.69 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  46.68 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.67 
 
 		 408 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.77 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  47.18 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  42.89 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  38.98 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.47 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.55 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.84 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.84 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.17 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.03 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.9 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.03 
 
 		 381 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.61 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1769  DNA polymerase III, beta subunit  33.86 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.75 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.85 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.45 
 
 		 378 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.59 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.06 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.59 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  27.59 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.21 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.21 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  31.42 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.93 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 		 374 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.67 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  23.54 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.75 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.24 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.61 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  26.56 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  25.14 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.27 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.1 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.95 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  26.09 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>