More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13640 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  100 
 
 		 650 aa  1333    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  65.74 
 
 		 631 aa  753    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  36.97 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  38.94 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.23 
 
 		 1005 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  35.35 
 
 		 591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  33.88 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  35.31 
 
 		 599 aa  308  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.73 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.36 
 
 		 586 aa  300  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.08 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.7 
 
 		 1004 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  32.46 
 
 		 608 aa  290  7e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  33.1 
 
 		 582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.72 
 
 		 603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.75 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.16 
 
 		 616 aa  280  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  33.77 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.45 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.58 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.39 
 
 		 582 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  38.94 
 
 		 589 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  32.22 
 
 		 582 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  32.22 
 
 		 582 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  36.76 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  35.34 
 
 		 588 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  36.93 
 
 		 598 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  38.48 
 
 		 591 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  36.72 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  36.62 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.23 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.82 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 589 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.52 
 
 		 957 aa  243  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.13 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.68 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.21 
 
 		 925 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  36.55 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  34.78 
 
 		 504 aa  238  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.18 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.18 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.18 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.18 
 
 		 596 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  36.55 
 
 		 596 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  36.55 
 
 		 596 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  36.76 
 
 		 597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.24 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  32.12 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.03 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.03 
 
 		 515 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  29.53 
 
 		 925 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  29.04 
 
 		 926 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  34.09 
 
 		 596 aa  230  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.11 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  34.38 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.33 
 
 		 589 aa  224  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 596 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.82 
 
 		 596 aa  217  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.67 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  32.29 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.36 
 
 		 510 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  30.83 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  33.12 
 
 		 635 aa  205  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.81 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.65 
 
 		 465 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 521 aa  200  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  29.14 
 
 		 515 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  28.27 
 
 		 657 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  30.04 
 
 		 512 aa  193  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  29.56 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.9 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.17 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  30.27 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  30.64 
 
 		 506 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.32 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  29.23 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  31.05 
 
 		 668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.37 
 
 		 519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  30.64 
 
 		 506 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  28.6 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  29.98 
 
 		 627 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  29.98 
 
 		 521 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  29.79 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 506 aa  177  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  30.46 
 
 		 507 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.98 
 
 		 500 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.33 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  29.3 
 
 		 505 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 506 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  30.77 
 
 		 519 aa  170  8e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  28.8 
 
 		 506 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  30.63 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  29.88 
 
 		 494 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  28.8 
 
 		 506 aa  167  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.11 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  28.31 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  30.85 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>