More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12790 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  72.54 
 
 		 448 aa  706    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  100 
 
 		 451 aa  934    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  60.63 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  51.27 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  49.07 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  49.89 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  48.14 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  50.84 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  48.82 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  44.94 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  45.43 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  46.38 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.83 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  34.87 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  35.79 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.32 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.44 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.29 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  35.32 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.11 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  35.32 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.11 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  34.64 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.19 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  36.08 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  32.06 
 
 		 375 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  35.82 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  34.92 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  32.38 
 
 		 376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.14 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.11 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  31.82 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.03 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  34.67 
 
 		 381 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  33.16 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.87 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.12 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  34.67 
 
 		 381 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  34.95 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.08 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.69 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  33.73 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  32.64 
 
 		 370 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.25 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  32.29 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.81 
 
 		 374 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  33.25 
 
 		 386 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.57 
 
 		 382 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  33.17 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.48 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.33 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  33.33 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  33.33 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.22 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  33.57 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  33.59 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.47 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  34.14 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  33.33 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  32.62 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  33.1 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  33.93 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  33.33 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  31.73 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  31.43 
 
 		 375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.55 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  32.37 
 
 		 379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  31.43 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  33.33 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  31.43 
 
 		 375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  31.74 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  31.19 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  33.41 
 
 		 372 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  30.18 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.28 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.44 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  34.65 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  32.86 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  32.2 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.6 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.69 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  31.59 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  31.59 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.08 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  33.59 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 386 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  32.54 
 
 		 385 aa  160  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.47 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  33.01 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  32.04 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  31.64 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  31.07 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  30.29 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.55 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.07 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>