73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  48.22 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  38.74 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  38.74 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  38.74 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  38.74 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  39.51 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  37.55 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  37.45 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.34 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  38.34 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  39.29 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  31.84 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.39 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.16 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  34.92 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.96 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  33.05 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  33.48 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  29.11 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.84 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  33.94 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  33.06 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  30.47 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.03 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.47 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.76 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.9 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  28.57 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  28.57 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  29.55 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  28.69 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  26.64 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.83 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  27.46 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  26.18 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  28.64 
 
 		 223 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  31.73 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.2 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.54 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.45 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  24.45 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  31.96 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.69 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  31.25 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  30.77 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  31.8 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.23 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.73 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.84 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  36.76 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  27.64 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  28.3 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  29.44 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  26.2 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  32.18 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.32 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  29.26 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  27.65 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  28.85 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  26.67 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  27.75 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  25.84 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  26.46 
 
 		 1611 aa  52.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  24.64 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.438202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>